More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0869 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
444 aa  896    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  59.29 
 
 
437 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  50.37 
 
 
412 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  51.17 
 
 
412 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  50.39 
 
 
412 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  50.13 
 
 
416 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  35.5 
 
 
415 aa  252  8.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 
414 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  33.43 
 
 
411 aa  162  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  33.15 
 
 
411 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 
413 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 
425 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  31.83 
 
 
411 aa  153  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
428 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
455 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
439 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 
466 aa  139  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
437 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
440 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 
436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 
464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.74 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
434 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 
449 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.16 
 
 
421 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
443 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.35 
 
 
402 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 
423 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
427 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 
419 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 
426 aa  106  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 
436 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
428 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 
447 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 
428 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
439 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 
424 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  24.06 
 
 
438 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 
420 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 
423 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
453 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  24.52 
 
 
433 aa  99  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 
414 aa  99  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 
522 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  23.76 
 
 
422 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 
438 aa  97.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 
399 aa  97.1  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.87 
 
 
434 aa  96.7  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
436 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 
411 aa  94  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.88 
 
 
439 aa  92.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  25.72 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.59 
 
 
452 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.88 
 
 
439 aa  92.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.28 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.72 
 
 
424 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.14 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.98 
 
 
410 aa  90.5  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 
422 aa  90.1  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
432 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  24.88 
 
 
447 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 
412 aa  89  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.09 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 
426 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.5 
 
 
422 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
448 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 
418 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 
483 aa  87.4  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
417 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.36 
 
 
421 aa  87  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 
411 aa  86.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.85 
 
 
418 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 
422 aa  86.3  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
423 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  28.41 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  26.29 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0900  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0889  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 
458 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 
430 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 
429 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.54 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>