More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0025 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
422 aa  863    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  65.23 
 
 
425 aa  564  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  64.32 
 
 
421 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  63.16 
 
 
423 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  63.84 
 
 
421 aa  530  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  51.46 
 
 
430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  51.49 
 
 
419 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  48.02 
 
 
423 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  49.12 
 
 
439 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  49.61 
 
 
423 aa  372  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  44.1 
 
 
424 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  43.87 
 
 
424 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  45.91 
 
 
421 aa  362  6e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  39.18 
 
 
421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  41.63 
 
 
420 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 
413 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  43.17 
 
 
411 aa  298  9e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  40.15 
 
 
522 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  41.48 
 
 
411 aa  292  8e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  41.48 
 
 
411 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  39.95 
 
 
414 aa  277  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  40.75 
 
 
428 aa  276  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 
439 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  33.77 
 
 
425 aa  209  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  34.99 
 
 
437 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 
455 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  34.7 
 
 
446 aa  199  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  35.46 
 
 
436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 
412 aa  186  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  33.07 
 
 
466 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  33.05 
 
 
464 aa  178  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  30.86 
 
 
419 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  32.39 
 
 
428 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  33.64 
 
 
438 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 
440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.82 
 
 
418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  33.43 
 
 
434 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  31.36 
 
 
428 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  31.35 
 
 
419 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 
426 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 
418 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  30 
 
 
421 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
447 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  29.56 
 
 
433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
363 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  26.54 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  29.04 
 
 
436 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  29.82 
 
 
412 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  29.82 
 
 
412 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  30.14 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.79 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
433 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 
441 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 
511 aa  101  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 
416 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
514 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.78 
 
 
431 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 
416 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.88 
 
 
439 aa  97.8  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 
427 aa  97.1  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 
429 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2482  extracellular solute-binding protein family 1  29.76 
 
 
400 aa  96.3  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0758562  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.75 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
419 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 
448 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 
437 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 
400 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
439 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 
447 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 
419 aa  89  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
411 aa  89.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
415 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 
435 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 
431 aa  88.2  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
465 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
465 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
465 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 
444 aa  87  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.63 
 
 
436 aa  85.9  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.03 
 
 
521 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
438 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  24.07 
 
 
468 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.27 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.79 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>