179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1041 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 416 aa  855    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  69.42 
 
 		 400 aa  569  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  51.92 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  49.25 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  45.05 
 
 		 433 aa  332  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 		 465 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 		 465 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 		 465 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  39.16 
 
 		 423 aa  279  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  36.57 
 
 		 468 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  35.78 
 
 		 464 aa  266  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  35.16 
 
 		 483 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 464 aa  210  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 436 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.44 
 
 		 434 aa  200  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  33.57 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  30.92 
 
 		 447 aa  187  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.67 
 
 		 436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  31.99 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  33.04 
 
 		 434 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  32.54 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  34.96 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.33 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0477  ABC-type sugar transport systems ATPase components-like protein  46.5 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  25.77 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 439 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  29.28 
 
 		 438 aa  116  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25.97 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 423 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 411 aa  114  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.06 
 
 		 421 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.8 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 464 aa  107  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 439 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 424 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 420 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  25.57 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.67 
 
 		 424 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 423 aa  93.2  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 466 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.15 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.35 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.54 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 724 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.26 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.72 
 
 		 496 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  20.11 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.82 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>