151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2264 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
514 aa  1048    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  42.69 
 
 
511 aa  363  4e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  44.52 
 
 
441 aa  344  2.9999999999999997e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2482  extracellular solute-binding protein family 1  44.09 
 
 
400 aa  297  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0758562  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
439 aa  136  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.99 
 
 
446 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 
421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 
425 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 
423 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
413 aa  120  7.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
411 aa  118  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.48 
 
 
421 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 
414 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 
437 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 
439 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 
419 aa  107  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
436 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
423 aa  104  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 
464 aa  104  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
425 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.84 
 
 
424 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
421 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 
423 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
424 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 
428 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 
440 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 
466 aa  98.2  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 
422 aa  97.8  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
411 aa  97.4  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
421 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
420 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
428 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 
430 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 
412 aa  84  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 
522 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 
447 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  24.92 
 
 
421 aa  77.4  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  25.51 
 
 
438 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
434 aa  71.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  21.5 
 
 
422 aa  67  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  21.38 
 
 
431 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 
433 aa  63.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  29.82 
 
 
446 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2483  sugar ABC transporter substrate binding protein  39.53 
 
 
103 aa  62  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  22.93 
 
 
433 aa  60.5  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
426 aa  60.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.88 
 
 
418 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  22.07 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
363 aa  58.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 
429 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.3 
 
 
434 aa  57.4  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.7 
 
 
426 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2958  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 
410 aa  57.4  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.347864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 
416 aa  57.4  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.01 
 
 
454 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 
422 aa  56.6  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 
410 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 
448 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 
458 aa  56.6  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 
412 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
433 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  33.61 
 
 
440 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 
427 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.45 
 
 
521 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  21.01 
 
 
435 aa  54.3  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 
437 aa  54.3  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
430 aa  53.9  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 
400 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  20.1 
 
 
424 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 
420 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 
464 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  30.95 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  20.67 
 
 
415 aa  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  22.1 
 
 
419 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 
425 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 
410 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 
426 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  21.66 
 
 
430 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
436 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4190  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
431 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 
416 aa  50.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
447 aa  49.7  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 
440 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  21.2 
 
 
434 aa  48.5  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3290  ABC glycerol-3-phosphate transporter, periplasmic binding protein, UgpB  24.51 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4022  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 
449 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
441 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 
431 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>