291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20490 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 
436 aa  886    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  52.8 
 
 
429 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  49.29 
 
 
437 aa  418  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  49.53 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  49.51 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  48.45 
 
 
447 aa  391  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  40.89 
 
 
464 aa  309  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  39.95 
 
 
436 aa  293  4e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 
423 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  30.75 
 
 
400 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 
465 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 
465 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 
465 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  33.24 
 
 
420 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 
416 aa  183  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  29.47 
 
 
468 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 
483 aa  176  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 
464 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.13 
 
 
402 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
428 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
411 aa  107  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
411 aa  107  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 
434 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.7 
 
 
418 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
411 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
436 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
414 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25.86 
 
 
446 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
453 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
440 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
428 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
423 aa  96.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
428 aa  93.6  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.59 
 
 
421 aa  87.8  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 
436 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
425 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  24.12 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 
421 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 
464 aa  79.7  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.03 
 
 
426 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
412 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  24.44 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  24.78 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  22.74 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  21.92 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.26 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
439 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.69 
 
 
521 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 
522 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 
435 aa  67  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  22.47 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 
391 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0061  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 
462 aa  64.7  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 
413 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 
392 aa  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 
448 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 
392 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 
363 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 
436 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.59 
 
 
460 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 
461 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1722  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 
476 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.902381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  20.86 
 
 
415 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
423 aa  60.5  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
433 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 
437 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  20.78 
 
 
408 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.64 
 
 
428 aa  57  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 
452 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
423 aa  56.6  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.63 
 
 
496 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 
439 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>