88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0013 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
511 aa  1035    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  68.42 
 
 
441 aa  645    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  43.84 
 
 
514 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2482  extracellular solute-binding protein family 1  48.26 
 
 
400 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0758562  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 
436 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
425 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 
439 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 
464 aa  104  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2483  sugar ABC transporter substrate binding protein  48.04 
 
 
103 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.35 
 
 
446 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
422 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
414 aa  99.8  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 
428 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 
421 aa  97.8  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
411 aa  96.7  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 
466 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
423 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
411 aa  96.3  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 
440 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
413 aa  94  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 
423 aa  93.6  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
424 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.14 
 
 
421 aa  92.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 
522 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
421 aa  91.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 
421 aa  91.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
419 aa  89.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 
428 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
425 aa  87.8  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.37 
 
 
424 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
430 aa  86.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  26.12 
 
 
421 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 
420 aa  77  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  20.62 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  25.66 
 
 
438 aa  67  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  23.2 
 
 
433 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 
427 aa  63.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 
447 aa  63.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
453 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 
473 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.94 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 
448 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 
436 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 
410 aa  60.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 
416 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 
433 aa  57  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 
400 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  20.54 
 
 
431 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 
418 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 
412 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 
464 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.22 
 
 
454 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.64 
 
 
434 aa  53.9  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
363 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  20.05 
 
 
424 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 
483 aa  52  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
437 aa  50.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.57 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  21.55 
 
 
412 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 
426 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0068  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 
486 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
447 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 
459 aa  47.4  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 
415 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 
419 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
420 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 
420 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
420 aa  45.8  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.93 
 
 
521 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  20.3 
 
 
449 aa  44.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 
440 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 
437 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.68 
 
 
465 aa  43.9  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 
410 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
436 aa  43.5  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  22.09 
 
 
430 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 
410 aa  43.5  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>