138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1199 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
483 aa  980    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  51.27 
 
 
464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  49.37 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  49.37 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  49.37 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  49.78 
 
 
468 aa  421  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  37.22 
 
 
420 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.8 
 
 
402 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  35.95 
 
 
400 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  34.82 
 
 
416 aa  269  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 
433 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  35.81 
 
 
423 aa  246  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 
464 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 
436 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.86 
 
 
434 aa  193  6e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  32.04 
 
 
447 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  31.81 
 
 
437 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 
429 aa  187  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.19 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 
419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 
428 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.51 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 
437 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
436 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
428 aa  118  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
436 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
455 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
453 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 
446 aa  113  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
428 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
414 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 
440 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
439 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
411 aa  94.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
411 aa  94.4  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 
413 aa  90.5  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
466 aa  89.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 
412 aa  87  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
425 aa  86.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  25.96 
 
 
421 aa  84  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
423 aa  83.2  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 
464 aa  82.4  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 
522 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  24.51 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
447 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.47 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
430 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  22.86 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.25 
 
 
424 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.23 
 
 
521 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  21.7 
 
 
422 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.51 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0477  ABC-type sugar transport systems ATPase components-like protein  30.77 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 
415 aa  67  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 
424 aa  64.3  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0080  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.39 
 
 
442 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 
431 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.03 
 
 
426 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 
419 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
412 aa  57.8  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 
429 aa  56.6  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 
449 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 
419 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 
420 aa  55.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 
420 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 
423 aa  55.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 
410 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 
410 aa  54.3  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 
430 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 
513 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 
511 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
473 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 
421 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 
410 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1666  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.68 
 
 
431 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
446 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>