More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0138 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
412 aa  832    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  43.81 
 
 
413 aa  355  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  42.27 
 
 
411 aa  331  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  42.27 
 
 
411 aa  330  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  41.69 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  38.69 
 
 
414 aa  299  7e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 
428 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 
421 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  35.58 
 
 
421 aa  212  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  31.4 
 
 
423 aa  206  8e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.41 
 
 
424 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 
424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  31.34 
 
 
422 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 
421 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 
425 aa  190  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 
439 aa  190  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 
419 aa  182  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  31.08 
 
 
437 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  30.62 
 
 
430 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  31.4 
 
 
440 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  31.75 
 
 
466 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
423 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  32.58 
 
 
522 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
436 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  31.73 
 
 
464 aa  161  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
420 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 
447 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
439 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  29.88 
 
 
421 aa  152  7e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  30.91 
 
 
422 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  30.93 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
455 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  28.39 
 
 
446 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  30.61 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  30.28 
 
 
419 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.99 
 
 
418 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  31.86 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 
453 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 
418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
426 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 
436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 
428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 
412 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 
423 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 
419 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 
409 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
386 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 
431 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 
412 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 
439 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 
439 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.64 
 
 
410 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.3 
 
 
428 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.62 
 
 
496 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.21 
 
 
434 aa  99  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 
435 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  24.63 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 
444 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 
446 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 
437 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
429 aa  97.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 
427 aa  96.3  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 
424 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
436 aa  94  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 
427 aa  93.6  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  22.72 
 
 
514 aa  93.2  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 
437 aa  92.8  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
436 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.92 
 
 
436 aa  92  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 
458 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 
433 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.49 
 
 
434 aa  90.1  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
410 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 
448 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 
387 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 
436 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
435 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  29.96 
 
 
435 aa  86.3  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 
435 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4399  extracellular solute-binding protein family 1  21.73 
 
 
455 aa  85.1  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0609802  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>