More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2622 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
437 aa  882    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  61.14 
 
 
444 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  45.5 
 
 
416 aa  346  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  45.02 
 
 
412 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  45.81 
 
 
412 aa  329  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  45.03 
 
 
412 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  35.16 
 
 
415 aa  232  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 
414 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 
411 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 
411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
425 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  31.84 
 
 
466 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 
411 aa  142  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  30.79 
 
 
464 aa  139  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 
428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 
440 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
439 aa  126  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
455 aa  120  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  23.73 
 
 
438 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 
436 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 
419 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 
427 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
399 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
449 aa  103  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
447 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
421 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
441 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  24.22 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
444 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.92 
 
 
366 aa  97.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
439 aa  97.1  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.74 
 
 
411 aa  97.1  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  25.58 
 
 
433 aa  96.7  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
428 aa  96.7  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 
428 aa  96.3  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
414 aa  94  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  23.84 
 
 
446 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  22.8 
 
 
422 aa  94  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
443 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
443 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
443 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
430 aa  93.2  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
423 aa  93.2  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
432 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.46 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.05 
 
 
452 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 
426 aa  90.1  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 
419 aa  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 
418 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  23.48 
 
 
447 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.88 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
432 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0080  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.18 
 
 
442 aa  86.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
443 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 
446 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 
446 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 
447 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 
522 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 
433 aa  84  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.06 
 
 
496 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 
418 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.87 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  22.74 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.87 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 
426 aa  80.1  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 
435 aa  80.1  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.12 
 
 
434 aa  79.7  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  30.74 
 
 
495 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.51 
 
 
410 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 
477 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 
439 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.91 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 
439 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.53 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>