More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0080 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0080  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 442 aa  912    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 412 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 412 aa  86.7  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0171  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 468 aa  86.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 437 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 441 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  34.32 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  30.92 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.12 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  23.12 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  27.73 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.47 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.47 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 455 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.47 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.89 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  24.89 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  25.32 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.32 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.32 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.32 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.32 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.32 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 435 aa  67  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.11 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 436 aa  64.7  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.15 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.25 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0496  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29870  carbohydrate-binding protein  27.04 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.54 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  25.93 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  21.21 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>