More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2237 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
466 aa  945    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  59.65 
 
 
464 aa  479  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  37.69 
 
 
428 aa  262  8e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  35.01 
 
 
437 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  39.1 
 
 
414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  39.25 
 
 
411 aa  228  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  39.25 
 
 
411 aa  227  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  35.07 
 
 
455 aa  222  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 
439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  37.72 
 
 
411 aa  217  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  31.49 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  35.34 
 
 
413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 
436 aa  205  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  32.49 
 
 
446 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.24 
 
 
424 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 
423 aa  186  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 
424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  36.46 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.84 
 
 
421 aa  184  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  33.5 
 
 
421 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  33.87 
 
 
423 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 
422 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
453 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  33.17 
 
 
434 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  31.15 
 
 
430 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  33.24 
 
 
447 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  31.4 
 
 
419 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
423 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  34.65 
 
 
522 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  31.23 
 
 
428 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 
420 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  34.86 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.51 
 
 
418 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 
428 aa  166  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  35.01 
 
 
439 aa  166  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  31.75 
 
 
412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  31.07 
 
 
422 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  30.94 
 
 
421 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  30.67 
 
 
438 aa  157  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 
419 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 
421 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 
412 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 
412 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  31.22 
 
 
412 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  31.84 
 
 
437 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 
418 aa  150  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 
425 aa  150  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  31.86 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 
363 aa  146  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 
444 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 
426 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
436 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 
415 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  29.25 
 
 
431 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 
410 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
433 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.03 
 
 
410 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.78 
 
 
402 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 
431 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 
419 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
465 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
465 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
465 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  30.27 
 
 
435 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 
448 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 
410 aa  106  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 
430 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 
419 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.37 
 
 
496 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.75 
 
 
422 aa  103  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.75 
 
 
422 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 
422 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 
437 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
446 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 
441 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 
423 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
424 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
412 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
404 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.06 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
411 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
439 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
439 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 
514 aa  98.2  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
412 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 
428 aa  96.7  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 
521 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
419 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 
511 aa  96.3  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.37 
 
 
437 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
424 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
437 aa  95.1  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
438 aa  94.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.37 
 
 
437 aa  95.1  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  26.83 
 
 
468 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.92 
 
 
426 aa  93.2  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
447 aa  92.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>