More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A4016 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  99.77 
 
 		 437 aa  900    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  100 
 
 		 437 aa  901    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  99.77 
 
 		 437 aa  900    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  58.87 
 
 		 428 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  43.25 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  40.1 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  42.93 
 
 		 452 aa  341  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  39.07 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 		 510 aa  123  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 443 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.7 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 447 aa  94.4  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  29.39 
 
 		 549 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 454 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 423 aa  90.5  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 		 567 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.12 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.43 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.5 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 404 aa  86.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.27 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  26.47 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.04 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.95 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  39.06 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  25.47 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.28 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.35 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.99 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  24.03 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.26 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.88 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.88 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.23 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.47 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  23.83 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  20.83 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>