More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0397 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
522 aa  1069    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  45.14 
 
 
423 aa  327  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  41.37 
 
 
439 aa  319  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  42.57 
 
 
421 aa  317  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  43.04 
 
 
430 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  41.71 
 
 
423 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  39.89 
 
 
421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  38.99 
 
 
421 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  40.99 
 
 
420 aa  302  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  39.85 
 
 
423 aa  298  2e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 
422 aa  294  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  41.4 
 
 
419 aa  293  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 
425 aa  286  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  39.79 
 
 
424 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  37.76 
 
 
424 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  39.09 
 
 
411 aa  261  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  39.09 
 
 
411 aa  261  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 
421 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  41.87 
 
 
411 aa  250  4e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  37.31 
 
 
414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
413 aa  229  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  36.1 
 
 
428 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  37.96 
 
 
437 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  35.31 
 
 
455 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  39.81 
 
 
436 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 
428 aa  190  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  36.73 
 
 
428 aa  182  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  30.39 
 
 
425 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  35.42 
 
 
419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  34.97 
 
 
439 aa  180  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  35.65 
 
 
446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  34.65 
 
 
466 aa  174  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  35.09 
 
 
434 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  34.13 
 
 
464 aa  162  9e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 
453 aa  156  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 
412 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.62 
 
 
418 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 
440 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  33.24 
 
 
421 aa  153  7e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  32.48 
 
 
426 aa  152  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  31.78 
 
 
438 aa  147  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
363 aa  147  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  30.96 
 
 
418 aa  144  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  30.15 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  29.73 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  31.49 
 
 
419 aa  125  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 
447 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
412 aa  123  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 
412 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 
412 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  31.21 
 
 
436 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 
433 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 
423 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  30.11 
 
 
448 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 
415 aa  97.8  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 
420 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 
444 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 
400 aa  94  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 
511 aa  91.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 
419 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 
441 aa  87.4  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 
419 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
449 aa  85.9  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.02 
 
 
454 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2482  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0758562  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  27.47 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
446 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.87 
 
 
402 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.91 
 
 
496 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 
437 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 
514 aa  81.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
386 aa  80.1  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 
419 aa  80.1  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 
431 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.51 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  27.12 
 
 
439 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
414 aa  76.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 
724 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.55 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>