More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_15281 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  100 
 
 
422 aa  857    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  59.13 
 
 
433 aa  488  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  56.32 
 
 
421 aa  482  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  43.38 
 
 
438 aa  329  7e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  38.28 
 
 
440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 
428 aa  219  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 
425 aa  211  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  32.89 
 
 
437 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 
413 aa  192  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  32.26 
 
 
446 aa  189  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 
421 aa  186  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 
455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  32.01 
 
 
464 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
411 aa  176  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 
419 aa  176  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  32.75 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 
439 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  30.69 
 
 
436 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  32.02 
 
 
419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 
424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
420 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.92 
 
 
424 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  31.07 
 
 
466 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
423 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  31.52 
 
 
439 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 
428 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 
421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.72 
 
 
418 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 
402 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 
430 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 
426 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 
423 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  29.27 
 
 
448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 
434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 
522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 
433 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
363 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 
412 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 
420 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
412 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 
418 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.3 
 
 
496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  21.53 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.06 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 
436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 
412 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
439 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
439 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
412 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 
449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 
421 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.7 
 
 
431 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 
430 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.47 
 
 
426 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 
400 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 
458 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.89 
 
 
521 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 
444 aa  99.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 
433 aa  99  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
465 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
465 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
465 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  24.83 
 
 
468 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 
431 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7337  ABC transporter substrate binding protein  25.06 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00127436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 
437 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.5 
 
 
454 aa  93.6  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.7 
 
 
439 aa  92  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.77 
 
 
439 aa  92  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 
447 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
386 aa  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  22.69 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 
432 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.04 
 
 
407 aa  86.7  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 
435 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  24.3 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.03 
 
 
434 aa  82  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.86 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.86 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.86 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>