More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1078 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  100 
 
 		 433 aa  882    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  64 
 
 		 421 aa  550  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  59.13 
 
 		 422 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  44.41 
 
 		 438 aa  296  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  37.41 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 428 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  32.52 
 
 		 411 aa  194  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  33.97 
 
 		 413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 414 aa  186  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  33.15 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 		 419 aa  177  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 		 447 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  31.2 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 		 439 aa  166  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 455 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  32.78 
 
 		 419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  31.86 
 
 		 466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  37.85 
 
 		 424 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  30.3 
 
 		 423 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  32.78 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 420 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 422 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 		 428 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  30.4 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  33.02 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 453 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.62 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.77 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 430 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 421 aa  123  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.09 
 
 		 496 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 419 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.33 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 		 416 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 447 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.78 
 
 		 454 aa  103  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  22.5 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 400 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  26.53 
 
 		 468 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 449 aa  98.2  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 444 aa  96.7  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 473 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.42 
 
 		 434 aa  91.7  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.67 
 
 		 431 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.08 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.44 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7337  ABC transporter substrate binding protein  24.94 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00127436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.87 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  23.88 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>