More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3339 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  100 
 
 
431 aa  866    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  58.97 
 
 
435 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  50.93 
 
 
433 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  52.16 
 
 
430 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
433 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  49.09 
 
 
426 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  44.76 
 
 
419 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
429 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
428 aa  157  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
455 aa  156  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
424 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 
437 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  30.86 
 
 
426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
439 aa  146  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
436 aa  145  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  31.09 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.06 
 
 
407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  27.88 
 
 
446 aa  137  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  27.05 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
411 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
411 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 
457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
399 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
406 aa  126  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 
425 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 
418 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 
423 aa  124  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
415 aa  123  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
392 aa  122  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
392 aa  121  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 
415 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 
441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 
417 aa  120  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 
466 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
391 aa  119  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5852  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  29.67 
 
 
421 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
391 aa  117  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 
430 aa  117  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.71 
 
 
430 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  26.21 
 
 
419 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.87 
 
 
434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.5 
 
 
439 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 
423 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.58 
 
 
406 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.33 
 
 
410 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 
419 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 
411 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.85 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.94 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  27.63 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
419 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
413 aa  110  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
420 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 
438 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  28.61 
 
 
410 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  28.61 
 
 
410 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 
434 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
390 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.19 
 
 
421 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 
411 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 
453 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
441 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 
421 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 
410 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
421 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
410 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 
423 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.69 
 
 
411 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
363 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 
432 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  24.7 
 
 
422 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
421 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 
412 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 
400 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 
411 aa  106  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  30.03 
 
 
456 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 
419 aa  106  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 
460 aa  106  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  26.38 
 
 
419 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.98 
 
 
419 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
415 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  26.38 
 
 
419 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.23 
 
 
400 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 
412 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>