More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2310 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
425 aa  867    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  53.9 
 
 
437 aa  484  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  44.92 
 
 
428 aa  354  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  41 
 
 
414 aa  279  7e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 
413 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 
411 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  37.15 
 
 
411 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 
439 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 
436 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
455 aa  246  8e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  33.42 
 
 
446 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 
411 aa  243  6e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  35.42 
 
 
428 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 
428 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 
440 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 
430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 
423 aa  212  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  32.42 
 
 
466 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  33.51 
 
 
464 aa  212  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
424 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  29.23 
 
 
422 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 
422 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
447 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  31.54 
 
 
434 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
421 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.75 
 
 
424 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  31.28 
 
 
419 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  32.52 
 
 
439 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  31.43 
 
 
423 aa  201  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 
420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  28.61 
 
 
438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.92 
 
 
421 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
453 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
421 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.38 
 
 
421 aa  190  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
421 aa  190  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
423 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 
418 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  30.57 
 
 
522 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.82 
 
 
433 aa  179  7e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 
419 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 
412 aa  176  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.37 
 
 
418 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 
416 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  29.92 
 
 
412 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 
412 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 
420 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 
444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 
426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
412 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
437 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.46 
 
 
402 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 
416 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 
423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 
415 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
363 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
400 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
433 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 
436 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 
514 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.51 
 
 
431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 
483 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
437 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
465 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 
399 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.9 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.12 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
429 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.51 
 
 
436 aa  111  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
411 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 
458 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.81 
 
 
411 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
511 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 
441 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  26.88 
 
 
439 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.28 
 
 
440 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 
449 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.41 
 
 
366 aa  106  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 
412 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  24.28 
 
 
468 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 
421 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 
435 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 
464 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 
419 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.38 
 
 
496 aa  103  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 
446 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
382 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 
386 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 
433 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 
412 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 
446 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 
439 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>