More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2119 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 382 aa  784    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  46.89 
 
 		 386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  44.03 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.11 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.86 
 
 		 439 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 448 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 439 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 428 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.67 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 411 aa  96.7  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 440 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 428 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  23.65 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 423 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 414 aa  93.6  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 464 aa  89  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 423 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.24 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.07 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 466 aa  86.7  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.49 
 
 		 366 aa  86.7  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.1 
 
 		 411 aa  86.3  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.08 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  29.15 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  26.96 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  21.79 
 
 		 422 aa  76.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  20.86 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  38.97 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  26.07 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  21.57 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.62 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.61 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.05 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  21.24 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  26.37 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.75 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.1 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4090  twin-arginine translocation pathway signal  21.82 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.25614 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  21.27 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>