273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3495 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  100 
 
 		 487 aa  992    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  58.49 
 
 		 477 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 498 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  26.29 
 
 		 447 aa  110  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 442 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  26.56 
 
 		 439 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  26.08 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 411 aa  92.4  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 414 aa  89.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2488  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 495 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.56273  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  26.07 
 
 		 484 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.58 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.58 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4078  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1357  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000953949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3021  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 487 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3164  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.625995  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3006  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.54 
 
 		 496 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.49 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2670  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 482 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00030492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.43 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.33 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.3 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 574 aa  67.4  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1283  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7451  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 499 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.33 
 
 		 439 aa  67  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3333  transporter, putative  23.82 
 
 		 481 aa  66.6  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 437 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.91 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  24.55 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1533  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.219593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.83 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6724  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 580 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 439 aa  62  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4090  twin-arginine translocation pathway signal  23.27 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.25614 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5372  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 580 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.737373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4379  extracellular solute-binding protein  36.29 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2986  putative signal peptide protein  23.55 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3225  putative sugar ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  22.29 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0178955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5060  extracellular solute-binding protein  36.29 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5800  extracellular solute-binding protein  36.29 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>