150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1283 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3333  transporter, putative  90.46 
 
 		 481 aa  871    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  96.18 
 
 		 497 aa  972    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1283  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 497 aa  1025    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  92.56 
 
 		 497 aa  954    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1357  extracellular solute-binding protein family 1  82.39 
 
 		 467 aa  808    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000953949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3006  extracellular solute-binding protein  81.74 
 
 		 467 aa  806    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2670  extracellular solute-binding protein  78.63 
 
 		 482 aa  796    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00030492  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3021  extracellular solute-binding protein  79.25 
 
 		 487 aa  818    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3164  extracellular solute-binding protein  81.96 
 
 		 467 aa  808    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.625995  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1533  extracellular solute-binding protein  61.86 
 
 		 478 aa  621  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.219593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1420  extracellular solute-binding protein  61.75 
 
 		 478 aa  615  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30312  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2375  transporter, putative  62.58 
 
 		 479 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.229304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 424 aa  91.3  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 408 aa  87.8  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  21.6 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 477 aa  80.1  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 536 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  25.26 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 419 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  23.99 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 443 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 432 aa  66.6  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 498 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.28 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.28 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  24.08 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.96 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  21.11 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.16 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.55 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  22 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  25.25 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 386 aa  57  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.32 
 
 		 326 aa  56.6  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 439 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  25.24 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.24 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.24 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.24 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.24 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  25.24 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  21.85 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 428 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 436 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 436 aa  54.7  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.38 
 
 		 486 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  23.93 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  21.82 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2229  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 580 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0301867  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  21.62 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2089  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 593 aa  51.6  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115344  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 435 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2204  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 579 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5939  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 610 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 431 aa  50.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1742  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.17 
 
 		 590 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3735  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.65 
 
 		 590 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217509  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1201  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 572 aa  50.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487559  normal  0.842714 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9075  hypothetical protein  24.65 
 
 		 558 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 574 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  22.9 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>