253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7822 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 486 aa  999    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  74.59 
 
 		 484 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7356  ABC transporter, binding protein  31.31 
 
 		 457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2118  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 557 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.34557 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6392  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 		 546 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 433 aa  126  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 428 aa  116  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 		 477 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 435 aa  113  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 477 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  25.05 
 
 		 436 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  24.32 
 
 		 484 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 513 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 419 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 536 aa  96.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 408 aa  96.7  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 447 aa  94  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 424 aa  92.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 451 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 		 437 aa  88.6  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 439 aa  87.4  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 412 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 446 aa  86.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.58 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 458 aa  86.3  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0883  twin-arginine translocation pathway signal  24.94 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0900  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0889  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.2 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.18 
 
 		 496 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0381  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 577 aa  80.9  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000205955  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0483  twin-arginine translocation pathway signal  24.74 
 
 		 579 aa  80.9  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.25 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0389  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 577 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.83487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0609  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 577 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3671  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00462233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1030  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2317  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000660046  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1445  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 579 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779886  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6724  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 580 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  25.16 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2229  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 580 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0301867  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5372  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 580 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.737373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3333  conserved hypothetical signal peptide protein  24.73 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3051  putative signal peptide protein  24.53 
 
 		 580 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0886733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9075  hypothetical protein  22.68 
 
 		 558 aa  74.3  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1533  extracellular solute-binding protein  31.55 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.219593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4211  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 598 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.64235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4889  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  25.2 
 
 		 596 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3735  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.74 
 
 		 590 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3630  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 580 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  24.71 
 
 		 438 aa  73.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3391  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 577 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2264  extracellular solute-binding protein, family 1  23.64 
 
 		 579 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.864304  decreased coverage  0.00109234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2986  putative signal peptide protein  24.54 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1367  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3473  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 579 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.971584  hitchhiker  0.00076059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1898  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 579 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.477877  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2204  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 579 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0100  hypothetical protein  23.14 
 
 		 574 aa  71.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0356789  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 441 aa  72  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1738  extracellular solute-binding protein  23.38 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217891 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 574 aa  70.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4387  ABC sugar (glycerol) transporter, periplasmic binding protein  23.81 
 
 		 573 aa  70.5  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3793  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.742912 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  25.37 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5939  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 610 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.95 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>