194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7451 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7451  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
499 aa  1028    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  34.98 
 
 
439 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2566  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 
478 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2488  extracellular solute-binding protein family 1  33.88 
 
 
495 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.56273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3225  putative sugar ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  30.26 
 
 
479 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0178955  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2011  extracellular solute-binding protein  32.78 
 
 
480 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4078  extracellular solute-binding protein family 1  29.98 
 
 
474 aa  229  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305211  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2164  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
481 aa  226  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2090  extracellular solute-binding protein family 1  30.62 
 
 
480 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2555  twin-arginine translocation pathway signal  30.52 
 
 
475 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2600  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 
475 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2594  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 
475 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 
428 aa  152  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4037  ABC sugar transporter, periplasmic lignad binding protein  27.5 
 
 
429 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0204263  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
444 aa  123  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.85 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.85 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  27.56 
 
 
439 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 
422 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 
442 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 
442 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0804  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
434 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793174  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
444 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
447 aa  100  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
443 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 
435 aa  98.2  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
436 aa  96.7  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  28.41 
 
 
435 aa  94.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 
449 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.22 
 
 
423 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 
452 aa  90.9  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 
450 aa  90.1  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 
440 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
436 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
468 aa  89.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 
436 aa  88.6  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0065  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.3 
 
 
426 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0354  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.3 
 
 
426 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.824168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1650  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.3 
 
 
426 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.572617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1232  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.3 
 
 
426 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 
478 aa  88.2  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1073  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.69 
 
 
399 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0230  putative transporter periplasmic binding protein  27.3 
 
 
426 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  27.91 
 
 
439 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1739  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.99 
 
 
426 aa  86.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3171  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0465993  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 
435 aa  84.7  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5309  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.5 
 
 
440 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0954  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 
397 aa  84  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.233769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
436 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  26.59 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.59 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.59 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.59 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.59 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.59 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  24.5 
 
 
464 aa  81.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0138  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.57 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.23 
 
 
438 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
449 aa  79.7  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 
498 aa  79.7  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2144  sugar-binding periplasmic signal peptide protein  26.39 
 
 
441 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000125903  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  27.21 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
436 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.38 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3065  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.97 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4737  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
455 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  26.3 
 
 
441 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  24.69 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5703  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
455 aa  75.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  24.63 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 
454 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  24.86 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 
441 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 
477 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  24.93 
 
 
436 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>