More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0671 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
436 aa  892    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  98.16 
 
 
326 aa  660    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  56.73 
 
 
447 aa  514  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0647  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  217  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0082339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
449 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  28.47 
 
 
433 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
408 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.5 
 
 
452 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 
441 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 
477 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  26.42 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 
536 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 
477 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
477 aa  96.3  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.65 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.95 
 
 
486 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
428 aa  94  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
411 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 
419 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 
414 aa  90.9  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
436 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 
419 aa  90.1  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.86 
 
 
439 aa  90.1  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
513 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 
484 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  26.93 
 
 
439 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
428 aa  87.8  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 
430 aa  87.4  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 
419 aa  87  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  27.29 
 
 
436 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.7 
 
 
425 aa  86.7  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.29 
 
 
439 aa  86.7  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2640  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932575  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2925  putative maltose/mannitol ABC transporter binding protein subunit  26.61 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.732093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 
458 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 
436 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0720  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.77 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000241977  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
435 aa  80.1  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
484 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
436 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  26.61 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.7 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.15 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1181  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 
490 aa  79.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.595766 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1985  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
441 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0378619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2595  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
441 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13364  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.23 
 
 
460 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  26.14 
 
 
487 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0490  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000283806  hitchhiker  0.00214005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2619  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
441 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.925096  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
438 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  23.98 
 
 
484 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
574 aa  77.8  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 
436 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0702  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
440 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.812706  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  25.11 
 
 
440 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 
424 aa  77  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  26.79 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 
454 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.79 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
439 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.79 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.79 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.79 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.79 
 
 
442 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  26.81 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0695  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  24.88 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1094  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  0.028756 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1108  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.633554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>