299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0646 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0646  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 326 aa  667    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0353327  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  98.16 
 
 		 436 aa  660    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  60.18 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  29.87 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 428 aa  93.6  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 449 aa  89.4  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.28 
 
 		 452 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 414 aa  86.7  5e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.28 
 
 		 439 aa  86.3  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.7 
 
 		 439 aa  82.4  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  27.14 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 477 aa  80.1  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  30.49 
 
 		 419 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 419 aa  79.3  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3144  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.08 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  29.36 
 
 		 477 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 574 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 451 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  46.48 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.95 
 
 		 486 aa  69.7  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  25.43 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1181  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.595766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 424 aa  67  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 		 536 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.6 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1390  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00129811  normal  0.103249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5939  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 610 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  21.78 
 
 		 426 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_007005  Psyr_1742  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.99 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3630  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 580 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4090  twin-arginine translocation pathway signal  23.81 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.25614 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0100  hypothetical protein  25.07 
 
 		 574 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0356789  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1201  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 572 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487559  normal  0.842714 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4387  ABC sugar (glycerol) transporter, periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2047  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 580 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120072  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2264  extracellular solute-binding protein, family 1  25.5 
 
 		 579 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.864304  decreased coverage  0.00109234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1898  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 579 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.477877  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3735  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.7 
 
 		 590 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1738  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 579 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3473  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 579 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.971584  hitchhiker  0.00076059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.94 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 431 aa  59.3  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1445  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1047  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1107  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192889  normal  0.929287 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2089  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3127  sugar ABC transporter  49.12 
 
 		 579 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1533  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.219593 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1321  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00160153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2663  ABC sugar (glycerol) transporter, periplasmic binding protein  23.35 
 
 		 574 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.716249  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 449 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 413 aa  57  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1969  extracellular solute-binding protein  42.47 
 
 		 588 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  26.96 
 
 		 439 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 466 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4399  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0609802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>