More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0870 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
419 aa  837    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  68.9 
 
 
418 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  44.79 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  45.89 
 
 
426 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  44.5 
 
 
428 aa  335  5.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  42.65 
 
 
434 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 
428 aa  249  8e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  36.53 
 
 
437 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  37.56 
 
 
414 aa  228  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  35.08 
 
 
453 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  39.89 
 
 
430 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  36.86 
 
 
448 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 
455 aa  217  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  37.2 
 
 
411 aa  216  7e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  36.93 
 
 
411 aa  215  9e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  34.99 
 
 
439 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  35.31 
 
 
413 aa  210  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 
411 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  30.59 
 
 
425 aa  206  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  37.06 
 
 
436 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  35.41 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  33.16 
 
 
439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  34.43 
 
 
420 aa  196  7e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  36.59 
 
 
423 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  35.34 
 
 
436 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  33.95 
 
 
440 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 
421 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  34.51 
 
 
420 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 
423 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  31.51 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  35.01 
 
 
400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  38.69 
 
 
433 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  35.42 
 
 
522 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 
421 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
422 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 
419 aa  177  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  31.4 
 
 
466 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 
425 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 
423 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  34.96 
 
 
416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  34.08 
 
 
464 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
424 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
465 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
465 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 
465 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.43 
 
 
421 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  33.33 
 
 
454 aa  167  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  32.02 
 
 
422 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.19 
 
 
424 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 
421 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  34.9 
 
 
447 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  32.14 
 
 
421 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  30.6 
 
 
468 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  33.6 
 
 
521 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 
483 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.33 
 
 
402 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  32.78 
 
 
433 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  31.91 
 
 
438 aa  146  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  30.55 
 
 
363 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  28.38 
 
 
418 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
412 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  32 
 
 
724 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  29.16 
 
 
464 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 
412 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 
415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  29.59 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
439 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
439 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
419 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  30.06 
 
 
464 aa  126  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
412 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 
447 aa  126  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  30.9 
 
 
473 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.38 
 
 
434 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.8 
 
 
496 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
416 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 
431 aa  122  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 
429 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.51 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
446 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 
449 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 
430 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  27.65 
 
 
444 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.35 
 
 
431 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 
437 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 
427 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 
382 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
423 aa  99.8  9e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  29.14 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 
449 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
424 aa  97.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 
421 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>