169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3610 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 724 aa  1447    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  31.93 
 
 		 419 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.07 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.34 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  32.63 
 
 		 448 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 428 aa  125  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 428 aa  125  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 		 434 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  28.73 
 
 		 428 aa  117  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 437 aa  110  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.93 
 
 		 454 aa  110  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 411 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 411 aa  107  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 425 aa  103  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 453 aa  101  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 464 aa  100  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 421 aa  99  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 439 aa  97.8  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 431 aa  97.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 419 aa  96.3  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.53 
 
 		 421 aa  94.7  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 413 aa  94.7  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  29.7 
 
 		 473 aa  94.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 423 aa  94.4  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 411 aa  92  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 430 aa  91.3  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 440 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  28.42 
 
 		 436 aa  90.1  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 414 aa  89.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 421 aa  89  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 423 aa  88.2  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 426 aa  87.8  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 420 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 424 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.29 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.28 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  24.86 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.94 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25.3 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.76 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 400 aa  73.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  26.04 
 
 		 438 aa  73.9  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 412 aa  73.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 419 aa  73.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  28.99 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 436 aa  70.5  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.15 
 
 		 496 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  28.09 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 363 aa  66.6  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.81 
 
 		 426 aa  67  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 425 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.38 
 
 		 452 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  26.1 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 427 aa  60.1  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  28.11 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.4 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.15 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 414 aa  57.4  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 436 aa  57  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 447 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 		 416 aa  57  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 399 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  20.6 
 
 		 421 aa  56.2  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>