More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2403 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 441 aa  896    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  93 
 
 		 443 aa  811    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  47.41 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 449 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3688  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.67 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 461 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 420 aa  109  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 422 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 421 aa  107  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 503 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 424 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 411 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.91 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 435 aa  99.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.87 
 
 		 410 aa  99  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 422 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 403 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 460 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.22 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 488 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  23.91 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 447 aa  94  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 488 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  21.61 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 419 aa  91.3  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.69 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 479 aa  90.1  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  21.38 
 
 		 416 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 410 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3271  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 473 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3143  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 473 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.536467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.79 
 
 		 426 aa  87  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 421 aa  87.4  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  21.58 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 465 aa  83.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  20.75 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  23.74 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  21.11 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 488 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 430 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.35 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.82 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  22.96 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 488 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  21.11 
 
 		 480 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.64 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.63 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  21.21 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  22.22 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  20.74 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  21.43 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22.07 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3000  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 450 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12341  periplasmic sugar-binding lipoprotein uspC  26.37 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  21.56 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  22.25 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 724 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>