More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_29320 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 443 aa  909    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  54.5 
 
 		 454 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  54.92 
 
 		 447 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 427 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.63 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  29.1 
 
 		 439 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  28.76 
 
 		 479 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2545  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 483 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 454 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 458 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 443 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 460 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.6 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 461 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.99 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.4 
 
 		 426 aa  90.1  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  23.35 
 
 		 416 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 418 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 430 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.56 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 456 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 445 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2819  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1595  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 440 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.780174  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.87 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.78 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  22.44 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.86 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2977  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 413 aa  73.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.03 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  22.02 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1585  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 453 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.89 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1046  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3591  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.317951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  20.47 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 457 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  22.04 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.85 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>