More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2571 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
417 aa  855    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  32.49 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  32.61 
 
 
416 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  32.61 
 
 
416 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  32.04 
 
 
418 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 
414 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 
420 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 
425 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  29.51 
 
 
435 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.02 
 
 
426 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 
445 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.75 
 
 
430 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  31.42 
 
 
460 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 
408 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
403 aa  117  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01900  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.92 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.867357  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 
413 aa  113  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 
424 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
504 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 
443 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 
417 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 
441 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 
413 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.23 
 
 
411 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.77 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.26 
 
 
407 aa  98.2  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
488 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 
399 aa  97.1  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3387  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
447 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
488 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 
412 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
412 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
422 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
431 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
424 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 
411 aa  94  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.64 
 
 
366 aa  93.6  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
503 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 
442 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 
435 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 
429 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 
448 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000348272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
449 aa  90.1  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
421 aa  89.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 
422 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 
443 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.71 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.07 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
393 aa  88.2  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 
428 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.26 
 
 
416 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.62 
 
 
426 aa  86.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  28.25 
 
 
408 aa  86.7  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.49 
 
 
464 aa  86.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.67 
 
 
450 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  23.84 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  25.28 
 
 
426 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.15 
 
 
431 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 
446 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
410 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 
480 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 
451 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  21.48 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 
450 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 
430 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.45 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
451 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>