More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3131 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  90.52 
 
 		 431 aa  794    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 422 aa  857    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  46.57 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  46.93 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  41.55 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  37.76 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  39.09 
 
 		 450 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  38.65 
 
 		 453 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  41.35 
 
 		 436 aa  296  5e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  41.04 
 
 		 436 aa  296  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  40.44 
 
 		 442 aa  295  8e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  38.66 
 
 		 450 aa  290  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  39.14 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  37.41 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.52 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 424 aa  232  9e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  32.41 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  31.31 
 
 		 442 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.87 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  31.74 
 
 		 428 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  31.34 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  32.57 
 
 		 446 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 		 429 aa  195  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  33.66 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  30.47 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  31.77 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  29.77 
 
 		 435 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 434 aa  170  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  32.33 
 
 		 460 aa  170  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 428 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  29.48 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  29.22 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 436 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 452 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 451 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.54 
 
 		 438 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 434 aa  136  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.45 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  30.42 
 
 		 427 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  25.23 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  25.23 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 428 aa  97.8  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.16 
 
 		 416 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  32.82 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 426 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.34 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.84 
 
 		 416 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 463 aa  90.5  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 418 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 422 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  29.39 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 440 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.07 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  30.32 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  28.87 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.24 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.55 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>