104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2228 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 460 aa  937    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  30.65 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  33.68 
 
 		 428 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  31.88 
 
 		 422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.17 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 450 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.66 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 453 aa  150  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 436 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  30.6 
 
 		 450 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 439 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  27.73 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  28.69 
 
 		 428 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.11 
 
 		 437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 437 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  28.41 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 434 aa  127  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 446 aa  123  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  28.97 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.75 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.52 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 441 aa  106  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 424 aa  97.8  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 428 aa  87  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.71 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  21.87 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  21.87 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  21.87 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 433 aa  67.4  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.81 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.39 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.11 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.7 
 
 		 416 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0192  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.25123  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.7 
 
 		 416 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 419 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.71 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.11 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.28 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 467 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  32.58 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.99 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  23.38 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2165  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 		 481 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  34.07 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0297  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0248346 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>