More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2114 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2114  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 428 aa  858    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  52.14 
 
 		 426 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1187  extracellular solute-binding protein  51.29 
 
 		 426 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2013  extracellular solute-binding protein family 1  48.35 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.991542  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1080  extracellular solute-binding protein  50.35 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  45.65 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.0502834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2254  extracellular solute-binding protein family 1  43.29 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534892  hitchhiker  0.00235651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10950  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.28 
 
 		 423 aa  286  4e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.575293  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  33.33 
 
 		 463 aa  230  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 432 aa  183  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  29.87 
 
 		 432 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  28.19 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0284  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3075  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  29.84 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01821  solute-binding family 1 protein  25.45 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0108  twin-arginine translocation pathway signal  24.94 
 
 		 435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.77402 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0152  putative sugar-binding protein  25.96 
 
 		 436 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.7 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.77 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2834  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.38 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  28.78 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  28.76 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.27 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.48 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.91 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  27.61 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.65 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  22.17 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1068  sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  27.02 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.238718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.27 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 430 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0528  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.02 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0589  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.13 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  33.15 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.62 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 483 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0748  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.09 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  33.78 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2846  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  29.85 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  26.47 
 
 		 448 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.08 
 
 		 439 aa  57  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  33.56 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  22.14 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 411 aa  55.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>