More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2197 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 429 aa  884    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  80.93 
 
 		 430 aa  734    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  97.2 
 
 		 429 aa  863    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  84.38 
 
 		 430 aa  760    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  76.22 
 
 		 428 aa  700    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  86.01 
 
 		 430 aa  772    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  80.93 
 
 		 430 aa  734    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  80.93 
 
 		 430 aa  733    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  60.68 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  56.16 
 
 		 430 aa  495  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  53.28 
 
 		 429 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  49.41 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  49.64 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  39.25 
 
 		 433 aa  309  8e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  40.05 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  37.9 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  36.3 
 
 		 430 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  37.16 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  31.74 
 
 		 438 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 428 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 450 aa  127  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 436 aa  120  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.46 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  22.77 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.69 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  25.06 
 
 		 427 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 434 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  27.58 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 436 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  21.96 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 427 aa  103  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 434 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.1 
 
 		 450 aa  98.2  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.13 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 450 aa  87  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.69 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  30.36 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  20.2 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  30.06 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  30.06 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 444 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.72 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.85 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  33.58 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  34.19 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  32.28 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>