More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2537 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 450 aa  907    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  52.03 
 
 		 442 aa  408  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  45.05 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  47.17 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  43.57 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  41.31 
 
 		 453 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  39.22 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  40.61 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  38.83 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  40.87 
 
 		 432 aa  305  7e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  39.15 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  38.16 
 
 		 428 aa  299  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  39.71 
 
 		 422 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  37.61 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35.7 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  37.75 
 
 		 434 aa  249  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.33 
 
 		 437 aa  204  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  32.71 
 
 		 442 aa  203  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  29.24 
 
 		 424 aa  200  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  30.77 
 
 		 427 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  29.74 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 		 434 aa  179  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  34.28 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.76 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  30.09 
 
 		 435 aa  169  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 451 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.54 
 
 		 416 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 428 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  29.31 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 460 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 441 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 434 aa  117  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  22.27 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 430 aa  111  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 438 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 430 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 414 aa  89.7  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  23.39 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  23.39 
 
 		 430 aa  87.8  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.9 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.16 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.31 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.55 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 429 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  31.45 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  25.32 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.23 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  29.94 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  33.53 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.79 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  32.14 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 431 aa  67  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>