More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2037 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  86.01 
 
 		 429 aa  773    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 430 aa  887    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  76.46 
 
 		 428 aa  691    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  80.7 
 
 		 430 aa  738    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  80.7 
 
 		 430 aa  738    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  91.16 
 
 		 430 aa  825    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  86.01 
 
 		 429 aa  772    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  80.47 
 
 		 430 aa  734    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  59.44 
 
 		 428 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  55.61 
 
 		 430 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  53.86 
 
 		 429 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  48.71 
 
 		 439 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  49.4 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  40.54 
 
 		 434 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  38.37 
 
 		 433 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  35.96 
 
 		 434 aa  290  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  36.79 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  35.7 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  34.72 
 
 		 438 aa  169  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 463 aa  147  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 441 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 432 aa  126  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 428 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 436 aa  126  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 431 aa  124  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 422 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.93 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  24.3 
 
 		 442 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 441 aa  113  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.38 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.93 
 
 		 438 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 428 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.79 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  25.62 
 
 		 427 aa  99.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.39 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  20.19 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  30.95 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  33.83 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  30.64 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  28.82 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.23 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5711  sugar uptake ABC transporter periplasmic solute-binding protein precursor  24.53 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.188634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.09 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.59 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.26 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.37 
 
 		 402 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 460 aa  67  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.48 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  29.58 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>