More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19770 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
423 aa  866    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  32.12 
 
 
486 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
399 aa  156  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
402 aa  151  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.57 
 
 
411 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  31.27 
 
 
427 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.49 
 
 
426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 
443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.57 
 
 
366 aa  132  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.45 
 
 
430 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  29.26 
 
 
430 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
410 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
410 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  31.1 
 
 
412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.76 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.34 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 
432 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  28.44 
 
 
434 aa  117  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 
433 aa  116  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 
412 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
504 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
435 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 
432 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
419 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
426 aa  113  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  27.3 
 
 
428 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.06 
 
 
422 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  26.35 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 
414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 
425 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
415 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
421 aa  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 
427 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
424 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.32 
 
 
407 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 
432 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.93 
 
 
431 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
445 aa  106  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 
425 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 
446 aa  106  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
450 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 
414 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 
422 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 
410 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 
433 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 
410 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 
412 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.84 
 
 
416 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
456 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
413 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 
426 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 
436 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 
422 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
411 aa  99.8  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 
453 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 
404 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 
419 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.35 
 
 
420 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
416 aa  98.2  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.57 
 
 
406 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
422 aa  96.7  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 
453 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 
437 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  26.68 
 
 
440 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 
433 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.39 
 
 
437 aa  95.9  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.21 
 
 
437 aa  95.5  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.07 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
447 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 
415 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 
459 aa  94.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
436 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 
428 aa  93.6  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4174  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
426 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4213  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
426 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.215316  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
441 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
455 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26 
 
 
446 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 
425 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.88 
 
 
430 aa  91.3  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 
458 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>