More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2696 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 420 aa  858    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  62.5 
 
 		 422 aa  547  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  54.59 
 
 		 451 aa  441  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  52.71 
 
 		 435 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  42.66 
 
 		 431 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  43.7 
 
 		 444 aa  352  5e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  36.53 
 
 		 448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  37.81 
 
 		 441 aa  253  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  34.25 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  34.54 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.5 
 
 		 435 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  36.1 
 
 		 442 aa  236  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  33.5 
 
 		 424 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  33.93 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  36.05 
 
 		 495 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  32.75 
 
 		 427 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  31.19 
 
 		 441 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  32.37 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.42 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  32.79 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  31.15 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  30.83 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 435 aa  177  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  30.98 
 
 		 424 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.2 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.78 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  31.22 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  30.83 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  30.2 
 
 		 433 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  30.85 
 
 		 441 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 434 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 432 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.26 
 
 		 426 aa  132  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  29.67 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  30.94 
 
 		 446 aa  123  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 436 aa  123  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 434 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.12 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.22 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.48 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  22.67 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.33 
 
 		 410 aa  104  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.83 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  29.79 
 
 		 455 aa  99.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 444 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 408 aa  99  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  22.55 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 439 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  26.59 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 493 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 445 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 452 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 421 aa  89.7  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 		 449 aa  89.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 443 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.99 
 
 		 380 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 422 aa  87  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 419 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 419 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 445 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.93 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>