More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1963 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 449 aa  924    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 422 aa  90.1  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 420 aa  89.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 451 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.59 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  28.3 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.24 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23.39 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.5 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.53 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.21 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.85 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.36 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.26 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 442 aa  66.6  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  25.25 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 411 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  22.42 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1317  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.68 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.68 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1722  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.902381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  23.15 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.62 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  26.81 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.45 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.46 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1947  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.709657  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>