More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1722 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1722  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 476 aa  957    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.902381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  54.65 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1410  extracellular solute-binding protein family 1  50.11 
 
 		 482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  51.64 
 
 		 473 aa  438  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  32.93 
 
 		 455 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 		 451 aa  163  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.83 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 424 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 399 aa  83.2  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 457 aa  67  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 421 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.74 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  31.34 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4758  extracellular solute-binding protein family 1  32.86 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  35.07 
 
 		 495 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.76 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  30.22 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5365  extracellular solute-binding protein family 1  32.52 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.559287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  20.88 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  33.63 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  39.44 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  31.5 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 446 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1174  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 		 502 aa  56.6  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 427 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  23.47 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  36.27 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 431 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 437 aa  54.7  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  29.82 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 434 aa  54.3  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  30.6 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  21.61 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  30.97 
 
 		 411 aa  53.9  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  21.61 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 449 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1047  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 433 aa  53.9  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.97 
 
 		 366 aa  53.9  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2252  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 469 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00844632  hitchhiker  0.0063434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 435 aa  53.9  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.17 
 
 		 457 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 		 480 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 414 aa  53.5  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  21.95 
 
 		 425 aa  53.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  24.29 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>