More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3779 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 430 aa  874    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  28.54 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.91 
 
 		 465 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 473 aa  83.2  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  33.51 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.09 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.74 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.81 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01287  predicted sugar transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.57 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2336  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1425  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.57 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2315  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1722  extracellular solute-binding protein family 1  28.04 
 
 		 476 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.902381 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01298  hypothetical protein  27.57 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1812  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.57 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1410  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1520  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.16 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.5 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  29.19 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.52 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0186  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  34.34 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0271  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  30.61 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.92 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.23 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0074  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.08 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  21.67 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1681  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.901925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 427 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  30.57 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  27.38 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 411 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 429 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.88 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.07 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  30.26 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  30.26 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2716  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.835001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1393  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.435309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  27.35 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>