More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2378 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 451 aa  914    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  48.32 
 
 		 455 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  43.11 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  39.14 
 
 		 465 aa  331  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  34.54 
 
 		 460 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1410  extracellular solute-binding protein family 1  34.56 
 
 		 482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  33.65 
 
 		 473 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1722  extracellular solute-binding protein family 1  33.09 
 
 		 476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.902381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 410 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 443 aa  87.4  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.09 
 
 		 403 aa  86.7  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.39 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 417 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1262  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.3 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.13 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013515  Smon_1046  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  23.97 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.75 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 424 aa  67  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.78 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.5 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  24.51 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.15 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.43 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.53 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0503  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000478191  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.53 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.72 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.88 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2071  twin-arginine translocation pathway signal  20.33 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 488 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  35.34 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.59 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.41 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2305  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0063  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.31 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.35 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2463  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1174  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>