More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6584 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  100 
 
 		 437 aa  882    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  36.1 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  36.43 
 
 		 434 aa  259  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  36.32 
 
 		 444 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  34.08 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  34.22 
 
 		 424 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  33.73 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  30.16 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 		 410 aa  147  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  34.32 
 
 		 450 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 457 aa  133  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.95 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.03 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.96 
 
 		 458 aa  119  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 480 aa  116  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  27.53 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.11 
 
 		 445 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.75 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.06 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 435 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 429 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 419 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  25.53 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 438 aa  93.2  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 435 aa  91.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 444 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 438 aa  86.7  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 440 aa  86.7  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 459 aa  86.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  25.86 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  23.57 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.8 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.47 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 459 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.14 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.13 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.06 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  24.56 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.71 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.2 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.06 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  28.44 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>