138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5459 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 422 aa  867    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  47.28 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  46.04 
 
 		 434 aa  349  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  44.09 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  39.5 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  40.67 
 
 		 447 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  40.78 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  40.05 
 
 		 450 aa  293  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  40.5 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  40.52 
 
 		 428 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  41.83 
 
 		 428 aa  275  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  40.62 
 
 		 433 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 		 462 aa  270  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  37.33 
 
 		 432 aa  269  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  36.52 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  37.18 
 
 		 434 aa  240  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  38.43 
 
 		 435 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  39.18 
 
 		 438 aa  239  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  39.18 
 
 		 430 aa  236  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  39.84 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  36.28 
 
 		 446 aa  219  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 431 aa  157  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  32.29 
 
 		 450 aa  156  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  29.8 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.12 
 
 		 416 aa  107  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  29.74 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 456 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  26.32 
 
 		 437 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  29.17 
 
 		 229 aa  90.5  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.09 
 
 		 453 aa  90.5  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.36 
 
 		 450 aa  90.5  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 		 434 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.77 
 
 		 458 aa  89  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.21 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.57 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 480 aa  79.3  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  26.87 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.45 
 
 		 447 aa  73.2  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 421 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.3 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  21.32 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.84 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.15 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  31.85 
 
 		 157 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 424 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.68 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.89 
 
 		 444 aa  53.5  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  21.62 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  25.38 
 
 		 440 aa  53.1  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.4 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  22.94 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  21.26 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  20.67 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 426 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 464 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  27.5 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  28.44 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.16 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.64 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>