More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04270 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 418 aa  859    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  48.74 
 
 		 410 aa  398  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  41.29 
 
 		 417 aa  336  5e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  38.13 
 
 		 420 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  39.47 
 
 		 452 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  39.47 
 
 		 452 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  50.44 
 
 		 229 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  31.67 
 
 		 424 aa  172  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 434 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 467 aa  156  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  29.35 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 		 438 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 462 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 434 aa  132  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 422 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  25.84 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.91 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.1 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  24.88 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 430 aa  110  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 424 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 435 aa  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  28.14 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  36.94 
 
 		 157 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 445 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 		 424 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 399 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.57 
 
 		 450 aa  94  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 433 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.65 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 449 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 414 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.76 
 
 		 447 aa  89.7  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 446 aa  89.7  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 		 441 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 433 aa  87  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.51 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.26 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  21.75 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.38 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.62 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.09 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.84 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.78 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.18 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  22.32 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>