152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3308 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 450 aa  915    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  58.41 
 
 		 447 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  47.79 
 
 		 433 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  48.39 
 
 		 435 aa  359  6e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  40.47 
 
 		 434 aa  332  9e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  42.41 
 
 		 432 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  40 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  39.5 
 
 		 433 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  36.61 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  33.41 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  33.19 
 
 		 424 aa  227  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 		 462 aa  223  7e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  34.55 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 434 aa  206  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  35.32 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  32.83 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  33.99 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  31.49 
 
 		 450 aa  190  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  33.49 
 
 		 441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  32.13 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  27.67 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 418 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  27.43 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.23 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 444 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 445 aa  99.8  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  30.77 
 
 		 229 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 430 aa  90.1  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 424 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.47 
 
 		 453 aa  87  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.21 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  24.41 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.62 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.2 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.63 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.14 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  22.49 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0525  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  32.79 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.39 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0825  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  22.6 
 
 		 428 aa  56.6  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0406  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 		 428 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00219397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 434 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.73 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  21.72 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  29.19 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.19 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  21.08 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7695  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.64 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397837  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  21.43 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>