235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3222 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 457 aa  926    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  38.56 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  32.11 
 
 		 434 aa  173  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 452 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 452 aa  127  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.33 
 
 		 453 aa  126  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.9 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.16 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  28.24 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.94 
 
 		 447 aa  116  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 		 440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  27.2 
 
 		 437 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.37 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 424 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 421 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 429 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  28.11 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.23 
 
 		 445 aa  96.3  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 424 aa  94.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 424 aa  93.6  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.74 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 445 aa  89  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 455 aa  87.4  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.06 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  30.29 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  23.82 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  21.33 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  21.33 
 
 		 504 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.86 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.65 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.84 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.61 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.97 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.92 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1085  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.474529 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2876  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736508 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  22.35 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  20.72 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0206  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 433 aa  57  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.5 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.5 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  26.76 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  24.77 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.64 
 
 		 407 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  21.96 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07110  carbohydrate-binding protein  25.28 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.666821 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  20.92 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 449 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>