138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1736 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 435 aa  886    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  51.38 
 
 		 434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  48.05 
 
 		 432 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  46.44 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  46.4 
 
 		 432 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  47.76 
 
 		 447 aa  381  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  44.39 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  43.33 
 
 		 428 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  43.16 
 
 		 433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  44.25 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  41.34 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  40.6 
 
 		 422 aa  299  8e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  36.88 
 
 		 438 aa  292  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  37.79 
 
 		 435 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  37.91 
 
 		 433 aa  253  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  37.78 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 		 434 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  39.53 
 
 		 430 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  36.39 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  36.56 
 
 		 441 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  35.19 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 		 431 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 		 418 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.58 
 
 		 416 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  28.01 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  27.29 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 		 454 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  32.71 
 
 		 229 aa  96.7  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 444 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 440 aa  90.9  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.56 
 
 		 437 aa  89.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.08 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.78 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 449 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.91 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.17 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.92 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 467 aa  66.6  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.21 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.6 
 
 		 445 aa  63.5  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.47 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.68 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  22.55 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 424 aa  53.5  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 399 aa  53.5  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  20.66 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  31.58 
 
 		 157 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.94 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.93 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.14 
 
 		 438 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 457 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  20.79 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.76 
 
 		 443 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  23.58 
 
 		 426 aa  50.1  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  25.43 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 441 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>