69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2611 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 450 aa  894    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  40.61 
 
 		 433 aa  283  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  37.72 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  36.77 
 
 		 424 aa  250  4e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  34.97 
 
 		 446 aa  250  4e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  37.85 
 
 		 441 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  37.01 
 
 		 430 aa  229  7e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  36.65 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 		 434 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.58 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  35.31 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  33.55 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  33.11 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  31.64 
 
 		 438 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  32.44 
 
 		 433 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  32.71 
 
 		 447 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  31 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 428 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 422 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  29.26 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 		 452 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 452 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.47 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.46 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  31.03 
 
 		 229 aa  65.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.5 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  23.7 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.44 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  22.99 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  22.62 
 
 		 437 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  21.34 
 
 		 424 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 421 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 445 aa  49.7  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.43 
 
 		 450 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  34.15 
 
 		 338 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  34.15 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0701  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 432 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 445 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 441 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>