194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3566 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 434 aa  878    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  38.75 
 
 		 432 aa  279  9e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 434 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  36 
 
 		 462 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  33.96 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  33.68 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  33.64 
 
 		 432 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  36.3 
 
 		 422 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  35.16 
 
 		 435 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  32.81 
 
 		 447 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  34.05 
 
 		 450 aa  220  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  34.1 
 
 		 433 aa  219  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 		 435 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  36.11 
 
 		 428 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  31.78 
 
 		 424 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  32.37 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  32.89 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 433 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.88 
 
 		 416 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  34.18 
 
 		 441 aa  176  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  31.71 
 
 		 438 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  30.75 
 
 		 430 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  29.08 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  31.13 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 418 aa  136  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  30.16 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 420 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.13 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 449 aa  97.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  27.04 
 
 		 437 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 504 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  28.44 
 
 		 229 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.58 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 421 aa  93.2  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.34 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 456 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 438 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.67 
 
 		 453 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  25.65 
 
 		 437 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.17 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 424 aa  79.7  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  30.39 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.86 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.05 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 480 aa  72.8  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.26 
 
 		 440 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 457 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.36 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.73 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.95 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.2 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 445 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  30.68 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  21.45 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.87 
 
 		 447 aa  57  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  27.08 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.38 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  31.21 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  24.06 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0661  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 415 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000689748  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  22.34 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0636  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000210277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>