More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0310 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 440 aa  882    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  65.37 
 
 		 437 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  55.53 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  39.06 
 
 		 444 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  42.45 
 
 		 445 aa  286  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  38.71 
 
 		 431 aa  285  9e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  39.37 
 
 		 434 aa  245  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.67 
 
 		 453 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  37.11 
 
 		 439 aa  230  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  32.92 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 441 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  33.66 
 
 		 449 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4188  extracellular solute-binding protein family 1  36.68 
 
 		 454 aa  196  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  34.57 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.52 
 
 		 444 aa  172  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.04 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.85 
 
 		 450 aa  169  8e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1762  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  32.06 
 
 		 438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000740157  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.59 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4059  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 		 440 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  30.69 
 
 		 456 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.29 
 
 		 458 aa  162  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 480 aa  158  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 		 457 aa  117  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.58 
 
 		 450 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 467 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 452 aa  103  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  25.26 
 
 		 437 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  26.28 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  26.46 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 432 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 456 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 454 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  22.52 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 446 aa  79.7  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.04 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1708  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  22.43 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.82 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.16 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1060  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.07 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.065415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.38 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  21.01 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.25 
 
 		 434 aa  67  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.46 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.69 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.87 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>